Στο ALIEN: Fate of the Nostromo, οι παίκτες παίρνουν το ρόλο των μελών του πληρώματος του Nostromo (Ripley, Lambert, Parker, Brett ή Dallas). Κατά τη διάρκεια του παιχνιδιού, συλλέγουν ανταλλακτικά, κατασκευάζουν αντικείμενα και εκπληρώνουν διαφορετικούς στόχους. Μόλις οι παίκτες εκπληρώσουν τους αρχικούς τους στόχους, θα πρέπει να συνεργαστούν προκειμένου να φέρουν εις πέρας μία από τις πέντε τελικές αποστολές. Για να κερδίσουν το παιχνίδι, οι παίκτες θα πρέπει να εκπληρώσουν όλους τους στόχους της τελικής αυτής αποστολής και να πληρούν ταυτόχρονα όλες τις απαιτούμενες συνθήκες. Προσοχή, όμως, γιατι το πλήρωμα χάνει ή αποκτάει ηθικό καθώς βρίσκεται αντιμέτωπο με το Alien και ανάλογα με τις διάφορες καταστάσεις που ανακύπτουν. Αν οποιαδήποτε στιγμή το ηθικό του πληρώματος φτάσει στο μηδέν, οι παίκτες χάνουν το παιχνίδι…
Το Alien μπορεί να παραμονεύει πίσω από κάθε γωνία και στο διάστημα κανείς δεν μπορεί ν’ ακούσει τις κραυγές σου…